基于Unet做医学图像分割
  FAf5WUfeTQSt 2023年11月22日 14 0


比赛介绍。

从前两年开始,我就开始对深度学习有一些兴趣,从自学开始,学习了机器学习的基本知识之后,发现兴趣越来越一发不可收拾,尤其是计算机视觉的领域,我有着浓厚的兴趣,因此我报名了这次Intel黑客松的比赛。在这次的比赛中,我非常的喜欢赛题2,因为这个和我喜欢的方向吻合,能够在检验我过去学习成果的同时,也可以让我学习到一些新鲜架构的使用和真实场景的应用。比如Intel One API架构等等。

模型介绍

基于Unet做医学图像分割_2d

首先是模型本身,Unet是一种用于图像分割的卷积神经网络模型。它由编码器和解码器两部分组成,其中编码器部分通过卷积和池化层逐渐提取图像的特征,解码器部分则通过反卷积和上采样层将特征还原为原始图像大小,并输出每个像素属于哪个类别的概率。Unet模型在医学图像分割领域有广泛应用。

Unet模型可以应用于医学图像分割任务中,并通过将全连接层替换为卷积层来实现像素级别的分类。通过使用卷积部分来提取图像中的特征,并使用反卷积层和卷积层来预测每个像素的标签,我们可以实现准确的像素级别分类,并取得良好的分割效果。

  1. 数据集的处理和模型训练对于数据集的处理和模型训练数据准备:收集并整理图像和对应的标签,标签可以是像素级别的掩膜或者是矢量边界框。数据增强:对图像进行随机旋转、翻转、缩放等操作,以增加数据量和模型的泛化能力。 划分数据集:将数据集分为训练集、验证集和测试集,通常采用70%、15%、15%的比例划分。 对于模型来说,要经历三个步骤:模型训练:使用训练集进行模型训练,通常采用交叉熵损失函数和Adam优化器进行训练。 模型评估:使用验证集对模型进行评估,通常采用Dice系数、IoU等指标进行评估。 模型预测:使用测试集对模型进行预测,生成分割结果,并进行后续的后处理和可视化。
import torch
import torch.nn as nn
 
class DoubleConv(nn.Module):
定义一个双层卷积块"""
 def __init__(self, in_channels, out_channels):
 super(DoubleConv, self).__init__()
 self.conv = nn.Sequential(
 nn.Conv2d(in_channels, out_channels, kernel_size=3, padding=1),
 nn.BatchNorm2d(out_channels),
 nn.ReLU(inplace=True),
 nn.Conv2d(out_channels, out_channels, kernel_size=3, padding=1),
 nn.BatchNorm2d(out_channels),
 nn.ReLU(inplace=True)
 )
 
 def forward(self, x):
 x = self.conv(x)
 return x
 
class Unet(nn.Module):
定义Unet模型"""
 def __init__(self, in_channels=3, out_channels=1, features=[64, 128, 256, 512]):
 super(Unet, self).__init__()
 self.ups = nn.ModuleList()
 self.downs = nn.ModuleList()
 self.pool = nn.MaxPool2d(kernel_size=2, stride=2)
 
定义编码器部分
 for feature in features:
 self.downs.append(DoubleConv(in_channels, feature))
 in_channels = feature
 
定义解码器部分
 for feature in reversed(features):
 self.ups.append(nn.ConvTranspose2d(feature*2, feature, kernel_size=2, stride=2))
 self.ups.append(DoubleConv(feature*2, feature))
 
 
后一层卷积
 self.bottleneck = DoubleConv(features[-1], features[-1]*2)
 self.final_conv = nn.Conv2d(features[0], out_channels, kernel_size=1)
 
 def forward(self, x):
 skip_connections = []
 
编码器部分
 for down in self.downs:
 x = down(x)
 skip_connections.append(x)
 x = self.pool(x)
 
最后一层卷积
 x = self.bottleneck(x)
 
解码器部分
 for idx in range(0, len(self.ups), 2):
 x = self.ups[idx](x)
 skip_connection = skip_connections[len(skip_connections) - idx//2 - 1]
 x = torch.cat([x, skip_connection], dim=1)
 x = self.ups[idx+1](x)
 
输出
 x = self.final_conv(x)
 return x

模型测试
   能够清晰的分辨出各个物体的轮廓,效果较好。

Intel架构设计
Intel Optimization for XGBoost是针对XGBoost机器学习库的优化工具。它利用Intel的硬件和软件优化技术,提供了更高的性能和效率。

使用Intel Optimization for XGBoost的好处包括:

更快的训练和推理速度:通过利用Intel的优化技术,可以加快XGBoost模型的训练和推理速度,从而节省时间和资源。
更高的性能和效率:优化工具可以提供更高的性能和效率,使得XGBoost在处理大规模数据集时更加高效。
更好的可扩展性:通过优化算法和并行计算技术,Intel Optimization for XGBoost可以提供更好的可扩展性,适用于处理大规模数据和复杂模型。
更好的模型准确性:优化工具可以提供更好的模型准确性,通过优化算法和特征选择技术,提高模型的预测性能。
总结。

Unet模型在医学图像分割领域有着广泛的应用,具有较好的分割效果和鲁棒性。在实际应用中,需要根据实际情况进行模型的调整和优化,例如增加数据增强操作、调整网络结构、改变损失函数等。


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最后一次编辑于 2023年11月22日 0

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