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生物信息学 标签描述

Dr.QiSun是康奈尔大学高级研究员和生物信息学中心主任,长期以来从事生物信息学工作,在大数据的管理与分析上,特别是Genotype-By-Sequence(GBS),RNA-seq,ChIP-seq,smallRNA,基因调控网络等方面积累了丰富的经验。在Science,Cell,NatGenet,NatureBiotechnol等高水平期刊上发表论文40余篇。 QiSun将生物信息和作物育种相结合,来中国也做过几场报告,介绍他们在农作物基因组辅助选择育种的低成本测序技术,如GBS、AmpSeq、和SkimSeq等。参考:https://www.biotech.cornell.edu/a...

动物所piRNA的高精度预测算法研究获得突破第二代测序技术又称作深度测序技术,应用到RNA上统称作RNA-seq或RNA测序,它已成为基因表达和转录组分析的重要手段。第二代转录组测序数据中含有大量不编码蛋白质的ncRNA序列,因为它们像宇宙中的暗物质一样难以识别和有重要功能,也被称为“基因组暗物质”。由于数据量巨大,保守性差,又有噪音干扰,这些“暗物质”的识别成为表观遗传学和调控网络研究的瓶颈。piRNA是数量最大的一类ncRNA,主要是通过与转座子的序列互补来控制转座子的表达,进而调控生殖和发育。由于不同物种的piRNA之间同源性很差,至今国际上还没有有效的识别方法。中国科学院动物研究所康乐...