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本文介绍了最新的一些分子力场中有可能使用到的1-5相互作用——双二面角耦合项的计算。而常规的计算方式是,通过量化的计算得到每一个Residue的α碳对应的两个二面角的数值在空间中的离散化数值。然后在分子模拟的过程中使用插值的方案,对相关的条目进行计算,例如使用双三次样条插值。但其实这种插值算法的使用有可能导致一些其他的问题,比如深度学习中可能会经常提到的“过拟合”问题。由于这个条目本身就只是一个修正项,从数值大小上来说并不算大,因此这些细节是否需要优化还有待商榷。 技术背景 当我们使用分子力场进行分子动力学模拟时,通常包括成键相互作用(键长项、键角项和二面角项)和非成键相互作用(范德华力)...

  UhoUqHJeImCQ   2023年12月12日   21   0   0 样条数据插值插值数据样条