Docker Ubuntu Slurm集群搭建

简介

Slurm是一个开源的用于高性能计算集群管理和作业调度的软件。本文将介绍如何使用Docker和Ubuntu来搭建一个Slurm集群，并提供一些代码示例供参考。

准备工作

在开始之前，我们需要安装Docker和Ubuntu。请根据官方文档下载和安装这两个软件。

架构设计

我们的Slurm集群将由一个控制节点和多个计算节点组成。控制节点负责管理集群中的资源和作业调度，计算节点用于执行任务。

下面是一个Slurm集群的架构示意图：

erDiagram
    Control_Node ||..|| Compute_Node : controls

搭建控制节点

首先，我们需要创建一个Docker镜像作为我们的控制节点。在本教程中，我们将使用Ubuntu作为操作系统。

首先，创建一个名为Dockerfile的文件，并写入以下内容：

FROM ubuntu

# 安装Slurm和其他必需的软件
RUN apt-get update && \
    apt-get install -y slurm-wlm

# 在容器启动时运行Slurm控制节点
CMD ["slurmd"]

接下来，使用以下命令构建Docker镜像：

docker build -t slurm-control-node .

构建完成后，我们可以运行一个容器来作为控制节点：

docker run -d --name control-node slurm-control-node

搭建计算节点

计算节点将通过Docker容器来运行。我们可以使用同样的Docker镜像来创建多个计算节点。

首先，创建一个名为compute-node.sh的脚本文件，并写入以下内容：

#!/bin/bash

# 获取控制节点的IP地址
CONTROL_NODE_IP=$(docker inspect --format='{{range .NetworkSettings.Networks}}{{.IPAddress}}{{end}}' control-node)

# 创建计算节点的Docker容器
docker run -d --name compute-node --link control-node:control-node slurm-control-node

# 将计算节点加入到Slurm集群
docker exec compute-node slurmd -N compute-node -c control-node

运行上述脚本以创建计算节点：

chmod +x compute-node.sh
./compute-node.sh

配置Slurm

现在我们已经成功搭建了Slurm集群的控制节点和计算节点，接下来我们需要进行一些配置。

首先，在控制节点上创建一个Slurm配置文件：

docker exec control-node mkdir -p /etc/slurm
docker cp slurm.conf control-node:/etc/slurm/

然后，启动Slurm服务：

docker exec control-node systemctl start slurmd
docker exec control-node systemctl start slurmctld

测试集群

现在我们已经完成了Slurm集群的搭建和配置，我们可以使用一些测试作业来验证集群的正常运行。

首先，创建一个名为job.sh的脚本文件，并写入以下内容：

#!/bin/bash
#SBATCH -N 1
#SBATCH -c 1

echo "Hello, world!"

然后，将该作业提交到Slurm集群：

docker exec control-node sbatch job.sh

您可以使用以下命令查看作业的状态：

docker exec control-node squeue

总结

通过使用Docker和Ubuntu，我们可以快速搭建一个Slurm集群，并在集群中提交和管理作业。这为高性能计算提供了一种简单和可扩展的解决方案。

希望本文能够对您了解Slurm集群的搭建提供帮助。如果您对Slurm或其他相关技术有任何问题，请随时在评论区提问。

谢谢阅读！

附录：Slurm配置示例

下面是一个Slurm配置文件的示例，您可以根据自己的需求进行修改和调整：

# slurm.conf
ControlMachine=control-node
ControlAddr=control-node
NodeName=compute-node CPUs=1 Sockets=1 CoresPerSocket=1 ThreadsPerCore